@edgarkater der Begriff'Museum' etwas weit gefasst aber die Unterwelten sind ein definitives must. Besonders die Begehung des Flakturms nähe Gesundbrunnen ist mir nach Jahren noch immer in Erinnerung.

https://www.berliner-unterwelten.de/en/guided-tours/tours-for-groups/from-flak-towers-to-mountains-of-debris.html

Ansonsten sind technisches Museum und Naturkundemuseum auch sehr schick.